Обучался в Йошкар-Олинском музыкальном училище им. И. Палантая, с 1968 по 1972 гг. в Московской консерватории у профессора Ю.Г. Ягудина. В годы учёбы в консерватории выступал на московской эстраде. Вернувшись в Йошкар-Олу, стал преподавателем отделения духовых инструментов музыкального училища.
С мая 1974 года по 1990 гг. Виталий Шапкин являлся первым флейтистом в оркестре Музыкального театра Марийской АССР под управлением дирижёра В. Венедиктова. Для него писали свои произведения марийские композиторы К. Гейст, А. Исандаров, А. Эшпай, В. Алексеев, Ю. Евдокимов, А. Яшмолкин и другие. Всего марийскими композиторами для него написано 65 произведений. Андрей Эшпай называл Виталия Шапкина лучшим флейтистом мира.
Виталий Шапкин представлял в год по две сольные программы в Санкт-Петербурге, Москве, Уфе, Казани, Астрахани, Краснодаре, гастролировал в Венгрии, Эстонии, Финляндии.
Им изданы автобиографические книги: «О чём молчит флейта... и не только о себе» (2005), «Моя флейта» (2012), «Эшпай в моей жизни: хроника встреч и творческой дружбы с Андреем Яковлевичем Эшпаем» (2014).
Звания: заслуженный артист РСФСР (1991), заслуженный артист марийской АССР (1980), лауреат Государственной премии Марийской АССР (1980), лауреат премии Марийского комсомола им. О. Ипая (1978).