Владимир Петрович Федотов родился в 1942 году в Перми, куда выехали из блокадного Ленинграда его отец профессор консерватории по классу флейты П. Я. Федотов и мать Н. В. Березинская — виолончелистка. В 1961 окончил музыкальное училище при Ленинградской консерватории, а в 1966 — Ленинградскую консерваторию по классу флейты у профессора И. Ф. Януса.
В
В 1986 году основал ансамбль старинной музыки «Ars Consoni», который явился продолжением деятельности старого, организованного ещё 1968 году при Ленинградской академической капелле имени М. И. Глинки. Новое название (Ars Consoni — искусство согласнозвучия) не просто перемена: ансамбль переориентировался на аутентичный, исторический подход. Музыканты играли на инструментах, позволяющих услышать музыку барокко в тех тембрах, для которых она была написана.
Владимир Федотов также был первым исполнителем в России музыки Булеза, Кейджа, Шёнберга, Веберна и других знаковых композиторов эпохи. Нелегально, в условиях «железного занавеса» организовывал «домашние» мастер-классы европейских флейтистов, приезжающих с концертами в СССР. Орель Николе, Карл-Хайнц Цоллер, Пьер Эсташ находились под впечатлением его личности и профессионального мастерства. Андрей Волконский, Алексей Любимов, Татьяна Гринденко, Андрес Мустонен, Иван Шумилов явились в определенный момент единомышленниками и партнерами. Музыканты блиставшего в
В исполнении В. Федотова записаны Концерт № 5 для флейты Антонио Вивальди, Симфония Алессандро Скарлатти для флейты и камерного оркестра и другие произведения классических и современных композиторов.
С 2000 преподавал в Санкт-Петербургской детской школе искусств им. Мравинского.